Dr. Birkan Alaycı · Clinical Trials Unit

Araştırma

Araştırma & yayınlar

Tıbbi kanıtın nasıl üretildiği ve nasıl bir araya getirildiği üzerine çalışıyorum: klinik araştırmalar ve kanıt sentezi metodolojisi.

Sistematik derleme ve meta-analiz süreçlerinde yeniden üretilebilir iş akışları geliştiriyorum; amaç, literatürdeki mevcut verinin daha şeffaf, izlenebilir ve hataya dayanıklı biçimde bir araya getirilmesi. Veri ve analiz kodunu açık paylaşmayı, iddiaları verinin taşıyabileceği sınırlar içinde tutmayı önemsiyorum.

Çalışma alanlarım

  • Klinik araştırmalar
  • Kanıt sentezi
  • Meta-analiz metodolojisi
  • Yeniden üretilebilir araştırma
  • Metabolik tıp & vücut kompozisyonu
  • Moleküler onkoloji

Açık kaynak projeler

Veri, kod ve otomasyon altyapısı GitHub’da açık.

glp1-lbm-dxa-meta-analysis

GLP-1 ve ikili GIP/GLP-1 reseptör agonistlerinin DXA ile ölçülen yağsız ve yağ kütlesi üzerindeki etkilerine dair meta-analizin verisi ve R kodu (faz 3 RKÇ’ler; BMC Endocrine Disorders, 2026; PROSPERO CRD420261323497).

  • meta-analysis
  • DXA
  • GLP-1
  • R

meta-analysis-automation-engine

Bilimsel meta-analiz otomasyonu: PubMed API, NLP, PDF ayrıştırma, halüsinasyon kontrolü ve yeniden üretilebilir araştırma altyapısı.

  • automation
  • NLP
  • reproducible research

Yayınlar

En güncel liste için ORCID ve Google Scholar profillerine bakınız.

  1. Makale 2026 Erken erişim

    DXA-measured lean and fat mass differences with incretin-based therapy versus comparators: a meta-analysis of phase 3 trials

    Birkan Alaycı, Öykü Zeynep Gerçek

    BMC Endocrine Disorders · doi:10.1186/s12902-026-02679-z

  2. Bildiri 2026 Kabul edildi

    Outcomes and Prognostic Factors of Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation in Patients Aged ≥65 Years with Acute Myeloid Leukemia: A Single-Center Retrospective Analysis

    Gülkan Özkan, Deniz Gören, Nurcan Özçelik, Birkan Alaycı, Mutlu Arat

    11th Congress on Controversies in Stem Cell Transplantation and Cellular Therapies (COSTEM 2026), Berlin, Germany · 1–4 October 2026

  3. Bildiri 2026 Kabul edildi

    Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation in Myelofibrosis: Risk Stratification Using MTSS and EBMT Score — A Single-Center Experience

    Gülkan Özkan, Birkan Alaycı, Nurcan Özçelik, Deniz Gören, Mutlu Arat

    11th Congress on Controversies in Stem Cell Transplantation and Cellular Therapies (COSTEM 2026), Berlin, Germany · 1–4 October 2026

  4. Bildiri 2026 Kabul edildi

    Outcomes of Second Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation in Patients with Acute Leukemia: A Single-Center Retrospective Analysis

    Gülkan Özkan, Deniz Gören, Nurcan Özçelik, Birkan Alaycı, Mutlu Arat

    11th Congress on Controversies in Stem Cell Transplantation and Cellular Therapies (COSTEM 2026), Berlin, Germany · 1–4 October 2026

  5. Makale 2025

    When Trimethoprim-Sulfamethoxazole Turns Pernicious: Type 4 Renal Tubular Acidosis in a Diabetic Patient With Sjögren’s Syndrome

    Öykü Zeynep Gerçek, Birkan Alaycı, Fatih Borlu

    Cureus · doi:10.7759/cureus.91588

  6. Makale 2022

    Frequency of Metabolic Syndrome in Paget’s Disease of Bone

    Rumeysa Selvinaz Erol, Esra Çil Şen, Feyza Yener Öztürk, Birkan Alaycı, Yüksel Altuntaş

    Med Bull Sisli Etfal Hosp 2022;56(3):360–364 · doi:10.14744/SEMB.2021.78861

  7. Makale 2014

    İnciraltı Yerleşkesinde Biyoistatistik ve Biyoinformatik Program Kullanım Sıklığı ve Farkındalığı

    Çalıbaşı G, Kaçar G, Doğan Y, Tarı M, Sarı B, Tonç S, Başaran B, Alizade N, Alaycı B, Engin OT, Canbeldek M, Alashqar A, Amırfalla A, Dağdeviren K, Akbarpour M, Uysal T, Çakıroğlu E, Baskın Y, Ellidokuz H

    Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 2014;28(2):45–50

Akademik profiller